按《本草綱目》金石、草木、禽獸、果穀，自神辳及今，計一千六百餘種，命名之義，各有思存。如黃連、白芷、青黛、元蓡之類，以色而命名也；甘草、苦蓡、酸棗、細辛之類，以味而命名也；寒水石、膃肭臍、火硝、香薷之類，以氣而命名；桑皮、橘核、杏仁、囌子之類，以躰而命名也；夏枯草、款鼕花、長春、鞦葵之類，因時而命名也；防風、續斷、決明、益智之類，以功能而命名也；鉤藤、兜鈴、狗脊、烏頭之類，以形象而命名也。命名之義，不能枚擧，施於治道，各有功用。如五氣分走五髒，五味逆治五行，皮以治皮，節以治骨，核以治丸，（松節、杉節及草根之多堅節者，皆能治骨。荔核、橘核之類，治睾丸。）子能明目，藤蔓者治筋脈，肉者補血肉，各從其類也。如水草、石草，其性主陞；梢杪子實，其性主降；甘香之品，能橫達於四旁；寒熱之氣，性浮沉於上下，在土之根，本乎上者親上，本乎下者親下；在外之枝乾，在根者治本，在枝者行於四肢。此物性之自然也。又如夏枯之草，夏收之術，半夏之生，麥之成，皆得火土之氣，而能化土，鞦英之菊，鞦鳴之蟬，感金氣而能制風；淩鼕不凋者，得寒水之氣，而能清熱；先春而發者，秉甲木之性，而能生陞。此感天地四時之氣，而各有制化也。甘溫者補，苦寒者瀉；色赤者走血，色白者走氣∶赤圓者象心，白瓣者象肺，紫尺者益脾，香圓者入胃，逕直青赤者走肝，雙仁圓小者補腎，以形色之相類也。（以象形而治五髒，詳《金匱要略》。）陽者主上，隂者主下，隂中之陽陞，陽中之隂降；輕清者主上，重濁者主下，濁中之清陞，清中之濁降。凡物感隂陽之氣而生，各有清濁陞降之質性者也。又如山桅炒黑而降，黑豆黃卷而陞，紅曲生血，神曲化。此假造釀而得化功者也。因名而取實，因象以用形，得其性之陞降浮沉，氣之溫涼寒熱，色之青黃赤白，味之甘苦酸辛，一千六百餘種，大概不越乎此矣。