子囊菌（Sac fungi）為產生子囊的菌類的總稱。根據愛因渥思（C．Ai-nsworth）和比斯貝（G．R．Bisby）的統計，共有1950屬、15000種。除單細胞的酵母菌外，營養體所謂菌絲中有隔膜。通過有性繁殖，在子囊中產生子囊孢子。并且菌絲組成菌絲體，形成含有子囊的子實體。無性繁殖一般是依靠分生孢子。子囊菌有以下幾種：不形成子囊果的原子囊菌綱；在假囊殼中形成雙層壁子囊的腔菌綱；在各種子囊果中形成單壁子囊的真子囊菌綱。在真子囊菌綱中又有：閉囊果中分散存在著球狀子囊，或子囊殼中柱狀子囊并列的核菌類；子囊盤內表面柱狀子囊并列的盤菌類。也有很多在各方面與子囊菌類似，但不知是否形成子囊一些種類，而把這些歸為半知菌綱。
子囊菌
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