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反轉錄病毒科

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1 拼音

fǎn zhuǎn lù bìng dú kē

2 英文參考

Retroviridae

3 中文名稱

反轉錄病毒科

4 英文名稱

Retroviridae

5 分類類型

6 反轉錄病毒科的成員

反轉錄病毒科分為兩個亞科7個屬。正反轉錄病毒亞科包括6個屬,分別為甲型反轉錄病毒屬乙型反轉錄病毒屬丙型反轉錄病毒屬丁型反轉錄病毒屬戊型反轉錄病毒屬慢病毒屬。泡沫病毒亞科僅含1個泡沫病毒屬

     
亞科 分離株組
正反轉錄亞科(Orthoretrovirinae) 甲型反轉錄病毒屬(Alpharetrovirus) 白血病病毒(Avian leukosis virus)   禽白血病病毒-RSA(Avian  leukosis virus - RSA)
  禽白血病病毒-HPRS103(Avian  leukosis virus - HPRS103)
勞氏肉瘤病毒(Rous sarcoma  virus)   勞氏肉瘤病毒布拉格C株(Rous  sarcoma virus (Prague C))
  勞氏肉瘤病毒施密特魯平B株(Rous  sarcoma virus (Schmidt-Ruppin B))
  勞氏肉瘤病毒施密特魯平D株(Rous  sarcoma virus (Schmidt-Ruppin D))
禽癌腫病毒-米爾希爾2株(Avian   carcinoma Mill Hill virus 2)  
禽成髓細胞病毒(Avian myeloblastosis  virus)    
禽成髓細胞病毒29(Avian  myelocytomatosis virus  29)    
肉瘤病毒CT10(Avian sarcoma virus  CT10)    
藤浪氏肉瘤病毒(Fujinami sarcoma  virus)    
UR2肉瘤病毒(UR2 sarcoma virus)    
Y73肉瘤病毒(Y73 sarcoma virus)    
乙型反轉錄病毒屬(Betaretrovirus) 綿羊慢性肺炎反轉錄病毒(Jaagsiekte  sheep retrovirus) 羊肺腺癌病毒(Ovine  pulmonary adenocarcinoma virus)
猴病毒(Langur virus)    
梅森-菲舍猴病毒(Mason-Pfizer  monkey  virus)   猴反轉錄病毒1型(Simian  retrovirus 1)
  猴反轉錄病毒2型(Simian  retrovirus 2)
鼠乳腺瘤病毒(Mouse mammary tumor  virus)    
松鼠猴反轉錄病毒(Squirrel monkey  retrovirus)    
丙型反轉錄病毒屬(Gammaretrovirus) 貓白血病病毒(Feline  leukemia virus)    
長臂猿白血病病毒(Gibbon ape leukemia  virus)    
豚鼠C型腫瘤病毒(Guinea pig type-C  oncovirus)    
鼠白血病病毒(Murine  leukemia  virus)   艾貝爾遜鼠白血病病毒(Abelson  murine leukemia virus)
  AKR鼠白血病病毒(AKR  (endogenous) murine leukemia virus)
  弗云德鼠白血病病毒(Friend  murine leukemia virus)
  莫洛尼鼠白血病病毒(Moloney  murine leukemia virus)
豬C型腫瘤病毒 (Porcine type-C  oncovirus)    
FBJ三氏鼠肉瘤病毒(Finkel-Biskis-Jinkins   murine sarcoma virus)  
加德納-阿姆斯坦貓肉瘤病毒(Gardner-Armstein   feline sarcoma virus)  
哈迪-朱克曼貓肉瘤病毒(Hardy-Zuckerman   feline sarcoma virus)  
哈維小鼠肉瘤病毒(Harvey murine sarcoma  virus)    
柯斯頓小鼠肉瘤病毒(Kirsten murine  sarcoma virus)    
莫洛尼小鼠白血病病毒(Moloney murine  sarcoma virus)    
斯奈德-泰雷貓肉瘤病毒(Snyder-Theilen   feline sarcoma virus)  
毛猴肉瘤病毒(Woolly monkey sarcoma  virus )    
蝰蛇反轉錄病毒(Viper retrovirus)    
小雞合胞體病毒(Chick syncytial virus)    
網狀內皮組織增生病毒(Reticuloendotheliosis   virus (strain T, A))  
雷格鴨脾壞死病毒(Trager  duck  spleen necrosis virus)  
丁型反轉錄病毒屬(Deltaretrovirus) 牛白血病病毒(Bovine  leukemia virus)    
靈長動物嗜T-淋巴病毒1型(Primate   T-lymphotropic virus 1)   人嗜T-淋巴病毒1型(Human  T-lymphotropic virus 1)
  猴嗜T-淋巴病毒1型(Simian  T-lymphotropic virus 1)
靈長動物嗜T-淋巴病毒2型(Primate   T-lymphotropic virus 2)   人嗜T-淋巴病毒2型(Human  T-lymphotropic virus 2)
  猴嗜T-淋巴病毒2型(Simian  T-lymphotropic virus 2 )
  猴嗜T-淋巴病毒PP型(Simian  T-lymphotropic virus -PP )
靈長動物嗜T-淋巴病毒3型(Primate   T-lymphotropic virus 3)   猴嗜T-淋巴病毒3型(Simian  T-lymphotropic virus 3 )
  猴嗜T-淋巴病毒L型(Simian  T-lymphotropic virus L )
戊型反轉錄病毒屬(Epsilonretrovirus) 大眼梭鱸表皮肉瘤病毒(Walleye  dermal sarcoma virus)    
大眼梭鱸外表皮增生病毒1型(Walleye   epidermal hyperplasia virus 1)  
大眼梭鱸外表皮增生病毒2型(Walleye   epidermal hyperplasia virus 2)  
金鱸增生病毒(Perch hyperplasia  virus)    
蛇反轉錄病毒(Snakehead retrovirus)    
慢病毒屬(Lentivirus) 免疫缺陷病毒(Bovine  immunodeficiency virus)    
馬免疫缺陷病毒(Equine infectious  anemia virus)    
貓免疫缺陷病毒(Feline   immunodeficiency virus )   貓免疫缺陷病毒Petuluma株(Feline  immunodeficiency virus(Petuluma))
  貓免疫缺陷病毒Oma株(Feline  immunodeficiency virus (Oma))
美洲獅慢病毒PLV-14株(Puma lentivirus  (PLV-14))    
關節炎腦炎病毒(Caprine  arthritis  encephalitis virus)  
維斯納病毒1514株(Visna/maedi   virus (strain 1514) )  
人免疫缺陷病毒1型(Human   immunodeficiency virus 1) 人免疫缺陷病毒1型M組A亞型(Human  immunodeficiency virus 1 Clade A) 人免疫缺陷病毒1型U455株(Human  immunodeficiency virus 1 U455)
人免疫缺陷病毒1型M組B亞型(Human   immunodeficiency virus 1 Clade B) 人免疫缺陷病毒1型ARV-2/SF-2株(Human  immunodeficiency virus 1  ARV-2/SF-2)
人免疫缺陷病毒1型BRU (LAI)株(Human   immunodeficiency virus 1 BRU (LAI))
人免疫缺陷病毒1型HXB2株(Human  immunodeficiency  virus 1 HXB2)
人免疫缺陷病毒1型RF株(Human  immunodeficiency virus  1 RF)
人免疫缺陷病毒1型MN株(Human  immunodeficiency virus  1 MN)
人免疫缺陷病毒1型M組C亞型(Human  immunodeficiency  virus 1 Clade C) 人免疫缺陷病毒1型ETH2220株(Human  immunodeficiency virus 1 ETH2220)
人免疫缺陷病毒1型M組D亞型(Human   immunodeficiency virus 1 Clade D) 人免疫缺陷病毒1型NDK株(Human  immunodeficiency virus 1 NDK)
人免疫缺陷病毒1型ELI株(Human  immunodeficiency  virus 1 ELI)
人免疫缺陷病毒1型M組F亞型(Human  immunodeficiency  virus 1 Clade F) 人免疫缺陷病毒1型93BR020株(Human  immunodeficiency virus 1 93BR020)
人免疫缺陷病毒1型M組H亞型(Human  immunodeficiency  virus 1 Clade H) 人免疫缺陷病毒1型90CR056株(Human  immunodeficiency virus 1 90CR056)
人免疫缺陷病毒1型O組(Human  immunodeficiency virus  1 Clade O) 人免疫缺陷病毒1型ANT70株(Human  immunodeficiency virus 1 ANT70)
人免疫缺陷病毒2型(Human   immunodeficiency virus 2) 人免疫缺陷病毒2型A亞型(Human  immunodeficiency virus 2 Clade A) 人免疫缺陷病毒2型BEN株(Human  immunodeficiency virus 2 BEN)
  人免疫缺陷病毒2型ISY株(Human   immunodeficiency virus 2 ISY)
  人免疫缺陷病毒2型ROD株(Human   immunodeficiency virus 2 ROD)
  人免疫缺陷病毒2型ST株(Human immunodeficiency virus 2 ST)
人免疫缺陷病毒2型B亞型(Human immunodeficiency virus 2  Clade B)  
猴免疫缺陷病毒(Simian  immunodeficiency virus) 非洲綠猴慢病毒組(African Green  Monkey (agm) SIVs) 非洲綠猴慢病毒TYO型(African  green monkey TYO)
非洲綠猴慢病毒155型(African green monkey 155)
非洲綠猴慢病毒3型(African green monkey 3)
非洲綠猴慢病毒gr-1型(African green monkey gr-1)
非洲綠猴Sab-1型(African green monkey Sab-1)
非洲綠猴Tan-1型(African green monkey Tan-1)
黑猩猩猴免疫缺陷病毒(chimpanzee SIV)    
鬼魈猴免疫缺陷病毒(mandrill SIV)    
長尾恒河猴SIV(pig-tailed macaque)    
紅帽白臉猴SIV(red capped mangabey SIV)    
煙熏白臉猴SIV H4(sooty mangabey SIV-H4)    
恒河猴SIV(Rhesus(maccaca mulatta))    
小粗尾恒河猴SIV(stump-tailed macaque (stm))    
賽克斯猴SIV(sykes monkey SIV)    
泡沫病毒亞科(Spumavirinae) 泡沫病毒屬(Spumavirus) 非洲綠猴泡沫病毒(African green  monkey simian  foamy virus)  
恒河猴泡沫病毒(Macaque foamy virus)    
猴泡沫病毒(Simian foamy  virus)   猴泡沫病毒人分離株(Simian  foamy virus human isolate)
猴泡沫病毒黑猩猩分離株(Simian foamy virus  Chimpanzee  isolate)
牛泡沫病毒(Bovine foamy virus)    
馬泡沫病毒(Equine foamy virus)    
貓泡沫病毒(Feline foamy virus)    

7 反轉錄病毒形態特征

反轉錄病毒粒子球形,具囊膜,直徑80-100nm,糖蛋白表面突起長約8nm。內部的核心球形或20面體,核心中包埋病毒核衣殼。乙型反轉錄病毒屬部分成員粒子和核衣殼是不同心形,屬B型病毒形態;還有部分成員具圓柱狀核心和低密度表面突起。甲型反轉錄病毒、丙型反轉錄病毒、丁型反轉錄病毒和泡沫病毒粒子和核衣殼是同心球形。慢病毒粒子是桿形或截短圓錐形。 存在兩個明顯不同的形態發生途徑。過去以電鏡觀察為基礎分類的甲型反轉錄病毒屬和丙型反轉錄病毒屬的成員,其不成熟核衣殼在質膜裝配,為C型病毒。與此不同,乙型反轉錄病毒屬成員先在細胞質裝配成A型病毒顆粒,然后以B型形態(小鼠乳腺瘤病毒)或D型形態(石工-鹿角猴病毒)出芽增殖。

8 反轉錄病毒理化特性

反轉錄病毒粒子在蔗糖中的浮力密度為1.16-1.18g/cm3,在蔗糖中的S20W為600S,對熱、去污劑和氯仿敏感。使用蛋白酶可部分去除粒子表面突起。粒子對紫外光(UV)有抗性。 病毒核酸 病毒基因組線形、正義單鏈RNA,由雙倍體組成,每個單體分子大小為7-11kb,基因組RNA占病毒粒子干重的2%,單體由氫鍵連接起來。每個RNA單體的3’端多聚腺苷化,5’端有帽子結構。純化病毒粒子RNA沒有感染性。每個單體都與一個特異的tRNA相關聯,特異tRNA與RNA近5‘端一個區域堿基配對,這一區域稱作引物結合位點。病毒粒子中還發現其它來源與宿主的RNA和小DNA片段。泡沫反轉錄病毒亞科成員的基因組由dsDNA組成,它是在病毒生命周期晚期反轉錄產生。DNA的精確結構還沒有確定。

9 反轉錄病毒蛋白質

反轉錄病毒粒子干重的60%是蛋白質。兩個囊膜蛋白分別為表面蛋白(surface,SU)和跨膜蛋白(transmembrane,TM),由病毒的env基因編碼。泡沫反轉錄病毒亞科一些成員還有第三個囊膜蛋白,稱為前導多肽(leader peptide,LP)。3-6個中間的非糖基化結構蛋白由gag基因編碼,從N端開始,這些蛋白有:(1)基質蛋白(matrix,MA);(2)部分病毒中的未知功能蛋白;(3)殼蛋白(capsid protein,CA);(4)核衣殼(nucleocapside,NC)。MA蛋白經常與甘氨酸N端共價連接的豆蔻基部分酰基化。其它蛋白還有蛋白酶(PR)、反轉錄酶(RT)和整合酶(IN)。一些病毒中出現dUTPase(DU)。泡沫反轉錄病毒亞科成員僅編碼一個Gag蛋白,該蛋白在約一半的C末端切割。丁型反轉錄病毒屬、戊型反轉錄病毒屬、慢病毒屬和泡沫病毒屬中的復雜病毒還編碼非結構蛋白。這些病毒中許多編碼轉錄反式活化子,它們需要LTR啟動子的表達。

10 反轉錄病毒脂肪

反轉錄病毒粒子干重的35%為脂肪,它們來源于宿主細胞質膜。 碳水化合物 病毒粒子重量的3%是碳水化合物,根據病毒不同,碳水化合物的含量有變化。至少一個SU,但囊膜兩面的蛋白通常都被糖基化。來源于宿主的糖脂也在病毒囊膜中發現。

11 反轉錄病毒基因組組成和復制

反轉錄病毒粒子攜帶雙拷貝基因組。感染性病毒主要有4個編碼粒子蛋白的基因,其順序為:5’-gag-pro- pol-env-3’,一些反轉錄病毒還有編碼非結構蛋白的基因,其編碼的蛋白對調節基因表達和調控病毒復制有重要意義。病毒攜帶的其它細胞源序列對病理發生重要,這些細胞序列是插入整個反轉錄病毒基因組中(如RSV),或者是缺失病毒序列的替換形式(如MSV)。這樣的缺失使病毒復制缺陷,但依靠非轉化的輔助病毒可產生具感染性的子代。在許多情況下,來源于細胞的序列與一個病毒結構基因形成融合基因,然后翻譯成嵌合蛋白(如gag-onc蛋白)。 所有反轉錄病毒RNA的結構組成大致相似,一般由gag、pol和env 3個基本基因構成,HTLV除了包含這3個基本基因外,還具有另一個長開放閱讀框LORF,稱為PX區。PX位于env基因和3’端長末端重復序列LTR之間,包含rex和tax基因,分別編碼調節蛋白,其功能與HIV的rev和tat基因編碼的產物相類似。rex編碼蛋白與原病毒DNA轉錄后的拼接調節有關,tax編碼蛋白可以反式激活病毒基因和T細胞基因的表達。 gag基因區主要編碼核心蛋白,它們也是一組特異性抗原。首先gag基因的全長mRAN編碼一種前體蛋白經過切割依次產生基質(MP)、衣殼蛋白(CA)、核酸結合蛋白(NC)。pol基因區編碼蛋白初產物經病毒蛋白酶切割產生氨基端和羧基端兩部分,其氨基端部分為反轉錄酶(RT),羧基端部分為整合酶(IN)。pol基因編碼的反轉錄酶還具有RNase H的活性。在gag和pol基因之間還存在一個pro基因,它編碼蛋白酶,專門負責對gag和pol基因編碼的前體蛋白進行切割。env基因區編碼兩種包膜糖蛋白,一種是分子量較大的外膜糖蛋白(surface protein,SU),另一種是小分子量的跨膜糖蛋白(transmembrane protein, TM),這兩種包膜蛋白決定著病毒感染的宿主范圍,并能誘導機體產生免疫應答。 病毒侵入由粒子糖蛋白與宿主細胞表面的特異受體相互作用介導,這種相互作用產生病毒囊膜和細胞質膜的融合,病毒粒子直接進行細胞內化,或隨后進行細胞內化。細胞受體是細胞表面蛋白,已鑒定的有四種。第一種受體CD4是HIV的受體蛋白,它是一個類似于免疫球蛋白的分子,其中具有跨膜區。第二和第三種受體是MLV和GALV的受體,它們參與小分子的轉移,其中有一個具多哥跨膜區的復合結構。第四個受體是ALV受體,它是一個具單一跨膜區的小分子,與低密度脂蛋白細胞受體遠源親緣。 病毒復制開始以tRNA的3’末端為引物,用反轉錄酶將病毒RNA反轉錄成負鏈cDNA轉錄本,起始的短序列轉移,通過RNA的雙倍體末端序列的功能,從基因組的3’端進一步合成cDNA。cDNA的合成涉及伴隨的病毒RNA消化(RT蛋白的RNase H活性),這種水解產物作為病毒RNA在負鏈cDNA轉錄本上合成的引物。在它的最后形式中,由病毒基因組而來的雙鏈DNA轉錄本含有長末端重復序列(LTRs),LTRs由病毒RNA 3’末端(U3)和5’末端(U5)側翼序列組成,它們位于病毒基因組的兩端附近。由于病毒復制過程中RT從一個RNA模板上轉移到另一個模板上,病毒復制有產生高重組率的特征。 反轉錄病毒DNA整合到宿主基因組DNA形成原病毒(provirus),這需要通過整合酶機制。病毒DNA加入細胞DNA中,需要從線形病毒DNA的末端去除兩個堿基,在整合位點產生一個細胞序列的短雙倍體。病毒DNA能在細胞基因組的許多位點整合,但一個序列一旦整合,便不能在相同細胞中進一步轉位。原病毒整合圖與非整合的線形病毒DNA共同存在,整合核能是病毒復制前所必需的。 整合的原病毒使用細胞RNA聚合酶II轉錄成病毒粒子RNA和對病毒LTRs信號響應的mRNA。在一些病毒屬中,轉錄也由病毒轉錄活化子調節。一個組成整個基因組的mRNA作為gag、pro和pol基因翻譯,這樣形成多蛋白前體,經過切割分別產生結構蛋白、蛋白酶、RT和IN。一個較小的mRNA由基因組5’末端拼接到基因組5’末端的序列組成,其中包括env基因和U3、R區,它被翻譯成囊膜蛋白前體。在含有附加基因的病毒中,產生另一種mRNA拼接形式,但所有mRNA都在5’端具有共有序列。在感染性反轉錄病毒中,絕大多數原始翻譯產物都是多聚蛋白,它們需要經蛋白酶切割才具有功能,gag、pro和pol的產物都是由一系列原始翻譯產物產生。對于pro和pol而言,翻譯涉及核糖體移框、在gag-pro上的通讀或跨越pro-pol邊界的通讀,從而繞過翻譯末端信號。 核衣殼的裝配在細胞質膜進行,或作為細胞質內顆粒裝配,病毒粒子通過出芽機制釋放,內部蛋白的修飾與粒子成熟同時進行,或者在粒子成熟后進行。

12 反轉錄病毒抗原特性

反轉錄病毒蛋白具有型特異性和組特異性決定子。一些囊膜糖蛋白的型決定子涉及病毒中和介導的抗體。組特異性決定子在一個血清組的成員中共有,也可能在一個特定屬的不同血清組成員中具有,在不同屬中沒有發現交叉反應生物學特性 反轉錄病毒作為脊椎動物的外源侵染因子廣泛分布,有時,由感染生物細胞產生的原病毒也可以作為宿主基因遺傳,它們在脊椎動物中廣泛發生。反轉錄病毒與多種多樣的疾病相關聯,這些疾病包括惡性的白血病淋巴瘤、肉瘤、其它中胚層腫瘤、乳腺癌腫、肝和腎癌腫、免疫缺陷、自動免疫、低運動神經元病、和其它幾種涉及組織傷害的急性疾病。一些反轉錄病毒不是病原。反轉錄病毒通過多種途徑進行水傳播,這些途徑包括血液唾液、性接觸等。病毒的垂直傳播通過直接感染發育胚胎,或者通過奶或圍產途徑。內源反轉錄病毒能通過原病毒遺傳。

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開放分類:生物學病毒
詞條反轉錄病毒科
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  • 評論總管
    2020/7/7 4:31:19 | #0
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本頁最后修訂于 2014年2月21日 星期五 17:55:03 (GMT+08:00)
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