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Alu序列

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1 拼音

Alu xù liè

2 注解

Alu重復序列是哺乳動物基因組中SINE家族的一員,約有50萬份拷貝。也就是說平均4~6 kb中就有一個Alu序列。由于這種DNA序列中有限制性內切核酸酶Alu工的識別序列AGCT,所以稱為Alu重復序列。典型的人基因組Alu序列長282 bp,由兩個同源但有差別的亞基構成。亞基來源于有缺失突變和點突變的7SLRNA基因。兩個亞基間由腺嘌呤核苷酸密集的序列連接。右邊的亞基中有無關的31 bp插入片段,稱為IH。Alu序列兩端各有一個正向重復序列,末端有一個poly(A)尾。

Alu序列一般散在分布,少數呈簇狀分布。在細胞遺傳學水平上觀察,Alu重復序列集中在基因轉錄最活躍的染色體區段內。在所有已知的基因內含子中,幾乎都發現了Alu序列。

與Alu序列亞基有很高同源性的7SLRNA是7SRNA的一部分,是將蛋白質運送到內質網以便分泌出胞外的信號識別顆粒(signal—recognition particle,SRP)的組成部分。7SRNA5,端的90個核苷酸同Alu序列左端同源,中間的160個核苷酸與Alu序列沒有同源性,而3,端的40個核苷酸與Alu序列右端同源。7SRNA基因是由RNA聚合酶Ⅲ轉錄的。人體Alu重復序列絕大多數要由RNA聚合酶Ⅲ轉錄成RNA,而且Alu 3,端有polyA尾,這些都提示Alu重復序列是通過RNA為中介,反轉錄成DNA后整合在基因組新位置上的。這里要提及的是,所有真核細胞里都含有3種RNA聚合酶;RNA聚合酶I負責轉錄rRNA基因,產生核糖體RNA(ribosomal RNA,rRNA);RNA聚合酶Ⅱ負責轉錄所有編碼蛋白質的基因,產生信使RNA(messenger RNA,mRNA),再由多聚腺嘌呤核苷酸聚合酶(poly(A)polymerase)負責加上poly(A)尾;RNA聚合酶Ⅲ負責轉錄轉移RNA(transfer RNA,tRNA)以及細胞核細胞質內的各種小RNA,這些被轉錄的基因一般長300bp左右,且在基因組的重復拷貝數可達幾千份甚至上百萬份。

Alu家族不同成員之間的一致序列(consensus sequence)的同一性平均達87%。小鼠基因組內約有5萬份拷貝的B1重復序列,長130 bp,與Alu的一個亞基的同源性達70%--80%。

哺乳動物基因組中為什么有這么多重復拷貝的DNA序列,目前還不是很清楚。現已發現,Alu序列中有一個14 bp的區段同乳多空病毒(papova virus)如SV40病毒,以及乙型肝炎病毒復制起始序列幾乎完全相同。這提示Alu序列很可能同真核生物基因組中的復制起始有某種相關,但這也存在爭論。因為Alu重復序列的拷貝數比復制起始點的預期數多出幾十倍。此外還發現,中國倉鼠的Alu類家族(Alu-equivalent family)的一些成員,當位于其他轉錄單位附近時,能在體內被轉錄生成單獨的RNA分子

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  • 評論總管
    2021/1/17 5:55:01 | #0
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